الهيكل الداخلي لوحدة مراقبة الدوام يتكون الهيكل الداخلي للوحدة عادةً من الأدوار التالية: 
رئيس الوحدة/القسم: المسؤول عن الإشراف العام، اعتماد التقارير الدورية، والرفع بالتوصيات للإدارة العليا.
مشرفو الفترات/القطاعات: (في المنظمات الكبيرة) لتوزيع المهام على مراقبي الأقسام المختلفة.
فريق الدعم الفني (التقني): المسؤول عن تشغيل وصيانة أجهزة البصمة، الربط الإلكتروني، ومعالجة أعطال الأنظمة.
المراقبون الميدانيون: المسؤولون عن الجولات التفتيشية للتأكد من وجود الموظفين في مكاتبهم (خاصة في الجهات التي تعتمد الرقابة الميدانية).
إداريو البيانات (مدخلو البيانات): لمعالجة طلبات الاستئذان، الإجازات، وتعديل الحركات الخاطئة في النظام. 
المهام الرئيسية المرتبطة بالهيكل 
إدارة نظام البصمة: سحب البيانات اليومية والتأكد من مطابقتها.
معالجة الفجوات: استقبال "تبريرات" نسيان البصمة أو الأخطاء التقنية ومعالجتها بعد موافقة الرؤساء المباشرين.
التقارير: إصدار تقارير الغياب، التأخير، وساعات العمل الإضافي لرفعها لقسم الرواتب.
الرقابة الميدانية: التأكد من سير العمل وفق الأنظمة واللوائح المتبعة.